Mary, spöket och resan genom natten är ett sprakande äventyr fyllt av drastisk humor, ömsint vemod, realism och magi. Tolvåriga Mary OHaras kära mormor Emer är döende. Varje kväll besöker Mary henne på sjukhuset och ingenting tyder på att Emer någonsin kommer kunna ta sig därifrån. Men så en dag dyker en mystisk kvinna upp. Säg åt din mormor att allt kommer att gå bra, viskar hon till Mary. Kvinnan visar sig vara Emers döda mor som inte lämnat sin dotters sida. Nu vill hon hjälpa Emer att ta farväl av sina nära och kära och våga släppa taget om livet. Så kommer det sig att fyra generationer kvinnor en mörk natt ger sig ut på en magisk resa.